磷酸铁锂和磷酸锰锂是两种不同的正极材料，它们在化学成分、物理性质和化学性质上存在明显的区别。
首先，在化学成分方面，磷酸铁锂的正极材料是FePO4，其中铁的含量占比较大，而磷酸锰锂的正极材料是MnPO4，其中锰的含量占比较大。因此，磷酸铁锂的化学式为LiFePO4（简称LFP），而磷酸锰锂的化学式为LiMnPO4。
其次，在物理性质方面，磷酸铁锂和磷酸锰锂具有不同的晶体结构和密度。磷酸铁锂具有橄榄石型的结构，密度为3.6g/cm3，理论比容量为170Ah/kg。而磷酸锰锂也具有橄榄石型的结构，比容量为171Ah/kg，电压平台较高，可达到4.1V。此外，磷酸铁锂的电导率较低，为10-4S/cm左右，而磷酸锰锂的电导率较高，为10-3S/cm左右。
最后，在化学性质方面，磷酸铁锂和磷酸锰锂也存在明显的差异。磷酸铁锂具有较好的热稳定性和化学稳定性，不易分解，安全性较高。而磷酸锰锂则具有较低的化学稳定性，容易分解产生气体，因此多用于和其它材料混合使用，以降低电芯成本。
此外，磷酸锰锂主要用于实验室阶段的新一代锂离子电池正极材料研发。与磷酸铁锂不同，由于磷酸锰锂大批量合成的难度以及电导率的改善困难程度等原因，国内尚未实现磷酸锰锂的商业化生产。